Регулятором рівня води в Каховському «морі» є однойменна гідроелектростанція, яка пошкоджена внаслідок бойових дій і наразі знаходиться в руках окупанта.
Хортицька заплава набула свого сучасного вигляду після наповнення чаші Каховського водосховища із поступовим збільшенням рівня води у 1958 році. Тобто насправді ми зараз спостерігаємо максимально наближений до історичного рівень води навколо Хортиці.
Хортицькі плавні за часів козацтва існували як періодично затоплювані весняним паводком ділянки суходолу.
Зараз на території Хортицької заплави оголені значні ділянки дна озер та більшості проток. На щастя, вода відступала поступово, що разом з особливостями рельєфу дна водойм дозволило рибі вийти у глибші руслові ділянки озер та Дніпро.
Найбільше страждають тварини та рослини, які обрали місцем свого існування мілководдя.
Зараз співробітники заповідника проводять дослідження, прибирання берегової смуги та осушених ділянок дна від сміття.